灵芝所含化学成分很复杂，包括如下几类：

1.多糖类：灵芝多糖及其单糖组成已被测定的有60多种。

2.氨基酸类：赤芝和薄盖灵芝中的氨基酸种类相似，只是各自含量不同，所含氨基酸有天门冬氨酸、谷氨酸、精氨酸、赖氨酸、鸟氨酸、脯氨酸、丙氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、缬氨酸、亮氨酸、苯丙氨酸、异亮氨酸、羟脯氨酸、组氨酸、蛋氨酸等，并发现赤芝孢子粉中有含硫氨基酸。

3.微量元素类：有机锗为主要的活性成分。有机锗的含量为人参的4～6倍，为强力免疫增强剂。

4.生物碱类：灵芝中的生物碱含量较低，我们从赤芝孢子粉及薄盖灵芝中分到的生物碱有胆碱(choline)，甜菜碱(betaine)，及其盐酸盐，灵芝碱甲(ganoine)，灵芝碱乙(ganodine)和菸酸。

5.三萜类：三萜类化合物是灵芝的主要成分之一，其中很多有生理活性。据报道灵芝酸A，B，C，D能抑制小鼠肌肉细胞组胺的释放。灵芝酸F有很强的抑制血管紧张素酶的活性。赤芝孢子酸A对CCl4和半乳糖胺及丙酸杆菌造成的小鼠转氨酶升高均有降低作用。

6.腺苷类：灵芝腺苷为核苷和嘌呤为基本构造的物质。为灵芝的主要成分之一。有灵芝嘌呤、腺嘌呤、腺嘌呤核苷、尿嘧啶、尿嘧啶核苷等。腺苷类具有抗凝解聚作用。

7.油脂类：有硬脂酸、花生酸、二十二烷酸等。

8.甾醇类：灵芝中甾醇含量较高，仅麦角甾醇含量就达千分之三左右。已知从灵芝中分到的甾醇有近20种，其骨架分为麦角甾醇类和胆甾醇两种类型。甾醇类化合物的提取分离多以乙醇提取原料，然后用乙醚提取，再用NaHCO3水溶液萃取乙醚溶液，除去酸性部分，然后用硅胶柱层析分离甾醇类化合物，甾醇类化合物的生理活性报道很少。目前已知的活性成分主要为灵芝三萜类化合物和多糖。