含数种内脂和黄酮。内酯类主要有脱氧穿心莲内酯(穿心莲甲素Deoxyandrographolide)、穿心莲内酯(穿心莲乙素Andrographolide)、新穿心莲内酯(穿心莲丙素、穿心莲甙Neoandrographolide)和脱水穿心莲内酯(穿心莲丁素Dehydroandrographolide)。黄酮类主要为甲氧基黄酮类。还含有甾醇皂苷、糖类、缩合鞣质等酚类物质。

1.穿心莲内酯：异名穿心莲乙素，分子式C20H30O5，分子量350.44。无色方形或长方形结晶，味极苦。mp.230℃～231℃，易溶于丙酮、甲醇、乙醇，微溶于氯仿、乙醚，难溶于水、石油醚、苯。

2.新穿心莲内酯：异名穿心莲丙素，穿心莲新苷。分子式C26H40O8，分子量480.58。无色柱状结晶，无苦味，mp.167℃～168℃。易溶于甲醇、乙醇、丙酮，微溶于水，较难溶于苯、乙醚、氯仿。

3.去氧穿心莲内酯：异名穿心莲甲素。分子式C20H30O4，分子量334.44。无色片状(丙酮、乙醇或氯仿)或无色针状结晶(醋酸乙酯)，mp.174℃～175℃，易溶于甲醇、乙醇、丙醇、氯仿，可溶于苯、乙醚。

4.脱水穿心莲内酯：分子式C20H28O4，分子量332.42。无色针状结晶(30%或50%乙醇)，mp.204℃，易溶于乙醇、丙酮，可溶于氯仿，微溶于苯，几乎不溶于水。主要成分与性质

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